Как необычна живопись Сергея Федотова, так оригинальна и подпись художника. Она представляет собой трансформацию букв С и Ф, то есть инициалов художника. Подпись органично встроена в живописную поверхность картин. Обычно их бывает две, но иногда и больше. Чаще  всего первая подпись располагается ближе к левому нижнему углу картины, а вторая – рядом с правым нижним углом. Но иногда композиция заставляет делать их  ближе к середине картины. Также важен цвет и тон подписей, обыкновенно «левая» (та, что в левом углу) «холоднее», чем «правая». Чрезвычайно важно направление и изгиб элемента подписей, которые корректируют направление движения взгляда, смотрящего на картину. Поэтому рассматривание подписей художника имеет отдельное эстетическое наслаждение.